學(xué)院高性能(néng)系統主要應用(yòng)為(wèi)計算化學(xué)方面的高性能(néng)計算工(gōng)作(zuò),主要應用(yòng)軟件是 VASP、Gaussian、等軟件。經過前期大量的測試,杭州網世了解到客戶的應用(yòng)對系統的需求特點,并根據需求特點設計整個系統。計算節點是承接集群的高性能(néng)計算任務(wù)的核心,具(jù)有(yǒu)浮點運算能(néng)力強,高性能(néng)大容量内存,低功耗,能(néng)夠共同協作(zuò)的特點。
網世産(chǎn)品及方案:計算節點,采用(yòng)10台雙路機架式服務(wù)器網世NF5280 M4,配置 2E5-2680 V4處理(lǐ)器;集群存儲系統,整套系統的存儲空間達到90TB以上;管理(lǐ)網絡,采用(yòng)千兆以太網絡承擔集群管理(lǐ)監控集群的任務(wù);計算網絡,采用(yòng) 56Gbps 線(xiàn)速Infiniband高速互聯網絡;集群調度系統,采用(yòng)網世Cluster Engine。滿足理(lǐ)學(xué)院集群多(duō)用(yòng)戶使用(yòng)和管理(lǐ)方面的需求。
通過該套HPC集群的部署,大大加快了理(lǐ)學(xué)院相關科(kē)研工(gōng)作(zuò)的進展速度,之前在單台工(gōng)作(zuò)站上通常需要運行數天甚至1周以上時間的算例,在集群系統上幾個小(xiǎo)時即可(kě)完成,且同時可(kě)滿足學(xué)院内多(duō)個科(kē)研人員的計算作(zuò)業。